前80年亚历山大港按托勒密十世的意愿正式受罗马管理。但此前一百多年中它已经受罗马影响了。前47年恺撒与克利奥帕特拉七世在亚历山大港相会。後来马克·安东尼也在此与克利奥帕特拉相会。屋大维则在亚历山大设立了一个皇家总督。
此时亚历山大又重复了其过去的繁茂，它控制着罗马帝国最重要的粮仓之一。这也是屋大维将它列入皇帝直接管理的城市的原因。215年罗马皇帝卡拉卡拉访问亚历山大港。由于市民的一些讽刺激怒了皇帝，卡拉卡拉下令处死所有能够佩戴武器的少年。他的命令造成了一场全面的大屠杀。 亚历山大港剧场遗址，亚历山大港也是新生的基督教的一个神学理论和管理中心。阿里乌教派是在亚历山大港出现的，亚他那修在这里设立了亚历山大宗主教，在此後两个世纪中这个宗主教成为基督教最有影响的人物。
当当地人在尼罗河谷的影响越来越强时，亚历山大港越来越脱离了它与埃及本土的关系。3世纪帝国内部的和平开始破裂时亚历山大港的人口和繁华剧降。
4世纪晚期基督徒迫害其它教的信仰者达到定点，在罗马帝国境内许多庙宇和神像被毁，异教仪式被禁，从事异教仪式甚至被处死刑。图书馆被关闭。391年罗马皇帝狄奥多西一世下令摧毁所有神庙。亚历山大港图书馆可能就是这个时候被毁的。另外据史料记载，亚历山大在该世纪里还遭受过一次海啸灾难。365年7月21日，由地中海沿岸地震引发的海啸造成了这个港口数千人的死亡。（参见）
5世纪中犹太人区和许多中心大建筑物被毁。
616年波斯国王科斯洛埃斯二世占领亚历山大港。虽然数年後拜占庭皇帝赫拉克留重新占领亚历山大港，但640年阿拉伯将军阿姆鲁·伊本·阿斯（Amr ibn al-As）在围困亚历山大港十四个月後占领亚历山大港，在这十四个月中亚历山大港没有获得任何来自君士坦丁堡的援助。赫拉克留刚死，而新继任的君士坦丁三世才12岁。阿姆写给他的主子哈里发奥马尔·伊本·哈塔卜说他占领了一个“拥有4000宫殿、4000浴池、12000油商、12000花匠、40000纳贡的犹太人和400剧院或其它娱乐场所。”
此後不久希腊人趁阿姆鲁率他的大多数军队外出再次占领亚历山大港。阿姆鲁闻讯後立刻返回恢复了对亚历山大港的统治。646年阿姆鲁被新的哈里发奥斯曼·伊本·阿凡（Uthman ibn Affan）撤职。阿姆鲁在埃及非常受欢迎，因此他的撤职在埃及导致了一场大暴动。拜占庭
皇帝立刻利用这个机会再占领亚历山大港。哈里发发现他犯了一个大错後立即恢复了阿姆鲁的职务。阿姆鲁回到埃及後再次围攻亚历山大港。他费了很大的劲才攻克亚历山大港。这使他非常生气，因此他下令拆毁亚历山大港的城墙，
此时亚历山大又重复了其过去的繁茂，它控制着罗马帝国最重要的粮仓之一。这也是屋大维将它列入皇帝直接管理的城市的原因。215年罗马皇帝卡拉卡拉访问亚历山大港。由于市民的一些讽刺激怒了皇帝，卡拉卡拉下令处死所有能够佩戴武器的少年。他的命令造成了一场全面的大屠杀。 亚历山大港剧场遗址，亚历山大港也是新生的基督教的一个神学理论和管理中心。阿里乌教派是在亚历山大港出现的，亚他那修在这里设立了亚历山大宗主教，在此後两个世纪中这个宗主教成为基督教最有影响的人物。
当当地人在尼罗河谷的影响越来越强时，亚历山大港越来越脱离了它与埃及本土的关系。3世纪帝国内部的和平开始破裂时亚历山大港的人口和繁华剧降。
4世纪晚期基督徒迫害其它教的信仰者达到定点，在罗马帝国境内许多庙宇和神像被毁，异教仪式被禁，从事异教仪式甚至被处死刑。图书馆被关闭。391年罗马皇帝狄奥多西一世下令摧毁所有神庙。亚历山大港图书馆可能就是这个时候被毁的。另外据史料记载，亚历山大在该世纪里还遭受过一次海啸灾难。365年7月21日，由地中海沿岸地震引发的海啸造成了这个港口数千人的死亡。（参见）
5世纪中犹太人区和许多中心大建筑物被毁。
616年波斯国王科斯洛埃斯二世占领亚历山大港。虽然数年後拜占庭皇帝赫拉克留重新占领亚历山大港，但640年阿拉伯将军阿姆鲁·伊本·阿斯（Amr ibn al-As）在围困亚历山大港十四个月後占领亚历山大港，在这十四个月中亚历山大港没有获得任何来自君士坦丁堡的援助。赫拉克留刚死，而新继任的君士坦丁三世才12岁。阿姆写给他的主子哈里发奥马尔·伊本·哈塔卜说他占领了一个“拥有4000宫殿、4000浴池、12000油商、12000花匠、40000纳贡的犹太人和400剧院或其它娱乐场所。”
此後不久希腊人趁阿姆鲁率他的大多数军队外出再次占领亚历山大港。阿姆鲁闻讯後立刻返回恢复了对亚历山大港的统治。646年阿姆鲁被新的哈里发奥斯曼·伊本·阿凡（Uthman ibn Affan）撤职。阿姆鲁在埃及非常受欢迎，因此他的撤职在埃及导致了一场大暴动。拜占庭
皇帝立刻利用这个机会再占领亚历山大港。哈里发发现他犯了一个大错後立即恢复了阿姆鲁的职务。阿姆鲁回到埃及後再次围攻亚历山大港。他费了很大的劲才攻克亚历山大港。这使他非常生气，因此他下令拆毁亚历山大港的城墙，