5世纪中犹太人区和许多中心大建筑物被毁。
616年波斯国王科斯洛埃斯二世占领亚历山大港。虽然数年後拜占庭皇帝赫拉克留重新占领亚历山大港，但640年阿拉伯将军阿姆鲁·伊本·阿斯（Amr ibn al-As）在围困亚历山大港十四个月後占领亚历山大港，在这十四个月中亚历山大港没有获得任何来自君士坦丁堡的援助。赫拉克留刚死，而新继任的君士坦丁三世才12岁。阿姆写给他的主子哈里发奥马尔·伊本·哈塔卜说他占领了一个“拥有4000宫殿、4000浴池、12000油商、12000花匠、40000纳贡的犹太人和400剧院或其它娱乐场所。”
此後不久希腊人趁阿姆鲁率他的大多数军队外出再次占领亚历山大港。阿姆鲁闻讯後立刻返回恢复了对亚历山大港的统治。646年阿姆鲁被新的哈里发奥斯曼·伊本·阿凡（Uthman ibn Affan）撤职。阿姆鲁在埃及非常受欢迎，因此他的撤职在埃及导致了一场大暴动。拜占庭皇帝立刻利用这个机会再占领亚历山大港。
哈里发发现他犯了一个大错後立即恢复了阿姆鲁的职务。阿姆鲁回到埃及後再次围攻亚历山大港。他费了很大的劲才攻克亚历山大港。这使他非常生气，因此他下令拆毁亚历山大港的城墙，但他似乎尽了所有的力量来保存市内的居民的生命。亚历山大港灯塔，亚历山大港的地位大降。969年开罗建城。1498年好望角航道的发现几乎完全打垮了它的经济。向它提供尼罗河水的运河被封。虽然它依然是埃及的一个重要港口。古城保留到今天的遗迹很少。由于地震造成的地面降低，王宫和居民区的大部分地区下沉到今天的港口内，其它遗迹被今天的建筑覆盖。“庞贝柱”是今天遗留下来的最著名的遗迹。它本来立在亚历山大的祭祀庙中，今天这是一座阿拉伯墓地附近的小丘。它有30米高，柱子由磨光的红花岗岩组成，基部直径约3米，顶部约2.5米。不过它与庞贝毫无关系，而是于293年由戴克里先树立的。祭祀庙下是阿匹斯神庙的遗迹，其雕刻的墙内的小空间可能被古代的图书馆用作贮藏室。庞贝柱，亚历山大港的地下墓室在庞贝柱西南不远，是一座多层的迷宫，进口是一个巨大的旋转楼梯。其中有十多个墓室，其中有雕刻的柱子、雕像和其它罗马-埃及混合的宗教符号、墓空和棺材。还有一个大的用来供亲属进行纪念宴会的罗马式的宴会厅。
目前亚历山大港最大的发掘区是古城保存良好的剧院和罗马时代的浴池的遗迹。最初亚历山大港仅由法洛斯岛组成。它与大陆通过一条被称为Heptastadion的约一英里长的大堤相连。今天这个过去的大堤的陆地一端位于大广场（Grand Square），过去这里是“月门”。所有从这一点到今天的Ras et-Tin广场之间的地方都是建造在渐渐堆积起来的。Ras et-Tin广场是法洛斯岛的唯一遗留物。
616年波斯国王科斯洛埃斯二世占领亚历山大港。虽然数年後拜占庭皇帝赫拉克留重新占领亚历山大港，但640年阿拉伯将军阿姆鲁·伊本·阿斯（Amr ibn al-As）在围困亚历山大港十四个月後占领亚历山大港，在这十四个月中亚历山大港没有获得任何来自君士坦丁堡的援助。赫拉克留刚死，而新继任的君士坦丁三世才12岁。阿姆写给他的主子哈里发奥马尔·伊本·哈塔卜说他占领了一个“拥有4000宫殿、4000浴池、12000油商、12000花匠、40000纳贡的犹太人和400剧院或其它娱乐场所。”
此後不久希腊人趁阿姆鲁率他的大多数军队外出再次占领亚历山大港。阿姆鲁闻讯後立刻返回恢复了对亚历山大港的统治。646年阿姆鲁被新的哈里发奥斯曼·伊本·阿凡（Uthman ibn Affan）撤职。阿姆鲁在埃及非常受欢迎，因此他的撤职在埃及导致了一场大暴动。拜占庭皇帝立刻利用这个机会再占领亚历山大港。
哈里发发现他犯了一个大错後立即恢复了阿姆鲁的职务。阿姆鲁回到埃及後再次围攻亚历山大港。他费了很大的劲才攻克亚历山大港。这使他非常生气，因此他下令拆毁亚历山大港的城墙，但他似乎尽了所有的力量来保存市内的居民的生命。亚历山大港灯塔，亚历山大港的地位大降。969年开罗建城。1498年好望角航道的发现几乎完全打垮了它的经济。向它提供尼罗河水的运河被封。虽然它依然是埃及的一个重要港口。古城保留到今天的遗迹很少。由于地震造成的地面降低，王宫和居民区的大部分地区下沉到今天的港口内，其它遗迹被今天的建筑覆盖。“庞贝柱”是今天遗留下来的最著名的遗迹。它本来立在亚历山大的祭祀庙中，今天这是一座阿拉伯墓地附近的小丘。它有30米高，柱子由磨光的红花岗岩组成，基部直径约3米，顶部约2.5米。不过它与庞贝毫无关系，而是于293年由戴克里先树立的。祭祀庙下是阿匹斯神庙的遗迹，其雕刻的墙内的小空间可能被古代的图书馆用作贮藏室。庞贝柱，亚历山大港的地下墓室在庞贝柱西南不远，是一座多层的迷宫，进口是一个巨大的旋转楼梯。其中有十多个墓室，其中有雕刻的柱子、雕像和其它罗马-埃及混合的宗教符号、墓空和棺材。还有一个大的用来供亲属进行纪念宴会的罗马式的宴会厅。
目前亚历山大港最大的发掘区是古城保存良好的剧院和罗马时代的浴池的遗迹。最初亚历山大港仅由法洛斯岛组成。它与大陆通过一条被称为Heptastadion的约一英里长的大堤相连。今天这个过去的大堤的陆地一端位于大广场（Grand Square），过去这里是“月门”。所有从这一点到今天的Ras et-Tin广场之间的地方都是建造在渐渐堆积起来的。Ras et-Tin广场是法洛斯岛的唯一遗留物。